Varianti Sars-Cov-2: à chì puntu hè a sequenza in Italia? Numeri, prublemi è regioni (più o menu virtuose…)
Covid: a sequenza hè essenziale per identificà e mutazioni è e varianti cunsiguenti, ma l'Italia (è oltre) pare ancu ùn stà à mantene a velocità di u virus. Eccu dati, paraguni è cumenti, cù una classificazione di e regioni virtuose
Omicron ci hà ricurdatu: a sequenza hè essenziale per scopre novi varianti, vale à dì sequencing a cumpusizioni genetica di campioni virali ottenuti da tamponi pusitivi.
U Centru Europeu per a Prevenzione è u Controlu di Malattie (Ecdc), è ancu l'Organizazione Mondiale di a Salute (OMS), avianu digià suggeritu chì i paesi mantenenu a so guardia è aumentanu i cuntrolli stabilendu u target minimu per tamponi à 5% pusitivu – 10% saria desideratu.
Tuttavia, i sforzi ùn sò micca abbastanza. Ci hè una grande distanza trà i paesi ricchi è poveri, ma ancu in Europa – cù rari eccezzioni – ùn hè micca tantu megliu. È l'Italia ùn hè micca inclusa in l'eccezzioni.
A SCOPERTA DI OMICRON IN SUD AFRICA
A variante Omicron hè stata identificata ghjovi scorsu in Sudafrica , induve solu 0.8% di i so campioni di virus sò sequenziati. È se una variante cù 32 mutazioni hè stata scuperta cù menu di 1% di cuntrolli, una volta, unu pensa chì a strategia deve esse veramente rinfurzata.
A SEQUENZA IN U MONDU
Sicondu una analisi di dati da u Washington Post , citata da Repubblica , emerge chì i Stati Uniti sequenzianu è sparte 3.6% di i so campioni di coronavirus cù altri paesi.
I Stati, ricorda u ghjurnale, "sò in u 20u postu trà i paesi chì anu sequenziatu 5 000 o più campioni. Un travagliu pertinenti ma sempre sottu à u ritmu chì, secondu i scientisti, hè necessariu per seguità i principali cambiamenti di u virus ".
In Africa, solu u Kenya hà un tassu di sequenza generale più altu.
L'India, ancu s'ellu hà aumentatu a so capacità di sequenza, ferma à u 0,2% di e mostre – in April era 0,06%.
In Europa, l'Islanda guida u ranking cù u 56,2% di i campioni di virus sequenziati. Altri esempi virtuosi sò u Regnu Unitu, a Germania è u Danimarca.
È IN ITALIA COME VA A SEQUENZA ?
U Ministru di a Salute, Roberto Speranza, hà ricurdatu u venneri scorsu: "Avemu un prugramma di sequenza è ricerca nantu à queste varianti, chì sò fatti in permanenza. A listessa cosa succede in a maiò parte di i paesi europei. Circheremu ancu più insistentemente, pruveremu à intensificà più a sequenza in u nostru cum'è in l'altri paesi ".
In i ghjorni passati, però, u ministru hà scrittu à e Regioni per intensificà sta pratica.
À u mumentu, però, scrive Il Fatto Quotidiano , "i dati italiani dispunibuli nantu à a basa di dati internaziunale Gisaid , induve i risultati di l'analisi di teste sò caricati, sò desolatori: solu 76 029 sequenze di Sars-Cov-2 dipositate da u 10 di ghjennaghju di u 2020, "1,53% di u numeru tutale di tamponi pusitivi".
U GAP REGIONAL
Il Sole24Ore , invece, informa chì a media naziunale in l'ultime settimane hà avvicinatu à 5%, mentre chì in dicembre 2020 era 2,7%. Tuttavia, risistenti differenze regionali significative.
"Dapoi u 9 d'ottobre – secondu l'ultimi dati publicati da l'Istitutu Superiore di Salute – solu in 5 regioni i laboratorii sequenzianu in media più di 5% di tamponi pusitivi: hè Lombardia (5,5%), Umbria (8, 4%). ), Abruzzo (6,5 %), Molise (15,4 %) è Sardegna (16,7 %) », scrive in u Sole 24 Ore Marzio Bartoloni chì seguita dapoi qualchì tempu i prublemi di a salute.
Ma sguassati questi esempi chì certamenti alzanu a media naziunale ", si scopre chì altre sei Regioni praticamente ùn eseguisce micca a sequenza di tamponi: a Toscana hè ancu à 0% di tamponi sequenziati cum'è Liguria, Piemonte à 0,1% cum'è Puglia , Veneto à 0,3% è Trentino à 0,5% ", aghjusta u ghjornu ecunomicu-finanziari.
INDUVÀ A SEQUENZA SI FA
Comme Start l'a rappelé il y a quelque temps, pour le séquençage en Italie, il y a une sorte de consortium spontané : « L'analyse des variantes est effectuée par les laboratoires des différentes régions, sous la coordination de l'Istituto Superiore di Sanità ».
Ciò chì pare manca hè una coordinazione cintrali, cum'è dichjara u genetista Marco Gerdol di l'Università di Trieste. "À a fine di ghjennaghju – hà scrittu Start – a Società di Virologia avia annunziatu a nascita di un cunsorziu di monitoraghju. Tuttavia, a crisa di u guvernu di u Conte II hà lasciatu u prugettu à un puntu ".
A PIATTAFORMA I-CO-GEN È U PRIMU CASU DI OMICRON IN ITALIA
A fine d'aprile hè stata lanciata a piattaforma per a sorveglianza genomica di e varianti di SARS-CoV-2 I-Co-Gen, a stessa chì sabbatuscorsu hà identificatu a prisenza di alcune mutazioni chì anu purtatu à a traccia di u primu casu di a malatia. Variante Omicron in Italia.
U genoma hè statu sequenziatu in u Laboratoriu di Microbiologia Clinica, Virologia è Bioemergency Diagnostic di l'Hospital Sacco in Milanu da una mostra positiva da un sughjettu di Mozambique.
A NEW TASK FORCE SPALLANZANI
"A sequenza hè fundamentale è in Italia hà cuntinuatu à fà cusì: ci permette di traccia u virus è gestisce situazioni complicate. In i ghjorni recenti, una nova task force hè stata aperta à Spallanzani, in Roma: mettemu tutta a nostra energia in a sequenza ", hà dettu u sottusegretariu di a Salute Andrea Costa . "Ci hè statu un avvisu à ricullà à 5% [di u swabs pusitivu sequenced, ED], chì permette di un aerial di lu virus. Avemu bisognu à incuragisce è cresce. Di fronte à una nova variante diventa fundamentale ".
BONA MA NON BONA
Graziano Pesole, prufessore di Biologia Moleculare à l'Università di Bari è coordinatore di a filiera italiana di u prughjettu internaziunale di sequencing Elixir hà dettu à Sole24Ore : "In cunfrontu cù i primi mesi, a sequenza hè più efficace è fluida, ma hè sempre delegata à l'Ircss. è l'Istituti zooprofilattici chì facenu un grande travagliu, ma chì anu una forza limitata ".
Ciò chì Gerdol hà sustinutu d'aprile pare esse statu intesu, in fattu, cum'è u ghjurnale di l'affari rimarca, ancu s'ellu si parla da longu di una reta naziunale di sequenza, utile oghje à a pandemia ma dumane à tutti i medicini, ùn ci hè nunda. tracce sempre "è ognunu cuntinueghja cum'ellu pò, cù u listessu staffu è u listessu equipaggiu di l'informatica di prima, è senza una cuurdinazione naziunale vera è robusta".
Questa hè una traduzzione automatica da a lingua italiana di un post publicatu in StartMag à l’URL https://www.startmag.it/sanita/varianti-sars-cov-2-a-che-punto-e-il-sequenziamento-in-italia-numeri-problemi-e-regioni-piu-o-meno-virtuose/ u Tue, 30 Nov 2021 08:56:45 +0000.